פרק זה מציג את שיטות המחקר ששימשו במסגרת התוכנית הלאומית לניטור המגוון הביולוגי: שאלות הניטור, מערך הניטור, איסוף הנתונים, עיבוד הנתונים, ניתוח הנתונים ותהליך המיפוי.
לפירוט נוסף ומורחב של שיטות המחקר וכלי המחקר ששימשו להכנת הדו"ח, יש לפנות לדו"חות הטכניים המשויכים לדו"ח זה, באתר המארג.